研究人員可以使用 Navinci 的基于鄰近連接的創(chuàng)新空間蛋白質(zhì)組學解決方案組合來可視化和量化蛋白質(zhì)、它們的相互作用以及細胞和組織中的修飾。

蛋白質(zhì)形成巨大、復雜的相互作用網(wǎng)絡(luò)來介導細胞功能。它們的表達和結(jié)合是動態(tài)的，細胞響應(yīng)內(nèi)部和外部刺激而上調(diào)或下調(diào)蛋白質(zhì)水平以及蛋白質(zhì)復合物的組裝和分解。蛋白質(zhì)功能可以通過翻譯后修飾 (PTM)、組織分布模式和亞細胞定位進一步完善。

蛋白質(zhì)并不是孤立發(fā)揮作用的。大多數(shù)蛋白質(zhì)功能是由蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用 (PPI) 和 PTM 介導的。蛋白質(zhì)相互作用組的一個節(jié)點的破壞可能會破壞整個網(wǎng)絡(luò)的平衡。因此，闡明 PPI 是了解健康和疾病中的細胞信號傳導途徑以及識別新藥物靶點的關(guān)鍵。  

為了充分了解蛋白質(zhì)功能的復雜性，有必要在其天然環(huán)境中觀察 PPI，然而，該領(lǐng)域的檢測工具歷來受到限制。使用免疫共沉淀、蛋白質(zhì)印跡或 FRET/BRET 測定等技術(shù)無法獲得蛋白質(zhì)動態(tài)的空間視圖，這些技術(shù)會破壞細胞和組織結(jié)構(gòu)或天然蛋白質(zhì)狀態(tài)。此外，使用傳統(tǒng)的免疫熒光 (IF) 和免疫組織化學 (IHC) 方法無法可靠地進行 PPI 研究，這些方法只能確定兩個熒光標簽是否出現(xiàn)共定位，這可能是分辨率限制的結(jié)果，而不是真正的結(jié)果。相互作用。

Naveni ®基于鄰近連接的檢測是下一代技術(shù)，可 通過檢測和可視化改進蛋白質(zhì)及其修飾的原位研究：

• 蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用
  

• 同時游離和相互作用的蛋白質(zhì)
  

• 翻譯后修飾（例如磷酸化）

• 蛋白質(zhì)定位和分布

建立在遺產(chǎn)之上

開發(fā)原始鄰近連接分析 (PLA) 的先驅(qū)者也構(gòu)建了 Navinci 的平臺。Navinci 的產(chǎn)品基于 Naveni ®鄰近連接技術(shù)，這是一種基于鄰近連接的方法，利用寡核苷酸設(shè)計和抗體-寡核苷酸綴合物的現(xiàn)代進步，在特異性、靈敏度、易用性和穩(wěn)定性方面比現(xiàn)有空間蛋白質(zhì)組學技術(shù)具有顯著優(yōu)勢。數(shù)據(jù)解釋。

優(yōu)異的特異性

Naveni ®鄰近連接技術(shù)使用一對精心挑選的 Navenibodies（與專有寡核苷酸臂綴合的抗體）來直接（即通過初級綴合物系統(tǒng)）或間接（即通過次級綴合物系統(tǒng)）檢測感興趣的靶標。僅當檢測到的蛋白質(zhì)距離為 40 nm 或更小時，Navanibody 對之間才會發(fā)生鄰近連接，從而確保 PPI 檢測。通過 Navenibody 對對靶標進行雙重識別，通過減少抗體交叉反應(yīng)性引起的非特異性結(jié)合來增強特異性。

高靈敏度

專有的 UnFold 檢測系統(tǒng)可放大信號，與現(xiàn)有選項相比，可以實現(xiàn)高靈敏度和更高的信噪比。當發(fā)生鄰近連接時，Navenibodies 上的寡核苷酸探針被激活并雜交以形成 DNA 環(huán)。添加聚合酶后，就會啟動滾環(huán)擴增 (RCA) 反應(yīng)，從而擴增環(huán)序列。這增強了信號強度，因為每個重復序列都可以通過單獨的熒光團標記的檢測寡核苷酸進行檢測，從而導致數(shù)百個熒光標簽標記單個 PPI。

清晰的目標檢測和定量

這些信號可以作為不同的熒光或顯色點進行檢測，可以通過熒光或明場顯微鏡（取決于所選的試劑盒格式）進行可視化。使用數(shù)字圖像分析或視覺解釋可以輕松量化結(jié)果。

無需人工表達

由于 Naveni ®鄰近連接技術(shù)，研究人員有望實現(xiàn)比傳統(tǒng) PLA 高達 10 倍的靈敏度提高，從而可以檢測內(nèi)源水平的低豐度蛋白質(zhì)或難以檢測的靶標，而無需實驗過度表達，并且只需極少的投入使用珍貴（且昂貴）的抗體。

與現(xiàn)有的組織學工作流程和設(shè)備兼容

所有 Navinci 產(chǎn)品均與現(xiàn)有的組織學工作流程和標準組織學設(shè)備兼容。可選擇明場顯微鏡和熒光顯微鏡，無需額外儀器。協(xié)議與核染料或組織學染色劑（如蘇木精和伊紅等）共染色兼容，可在保留的細胞或組織結(jié)構(gòu)內(nèi)提供目標 PPI 的可視化。